九十九湾に併設される磯の観察路では海を身近に観察することができます。

また、本館のタッチプールでは、ヤドカリやヒトデなどの海の生きものに直接ふれることができます。

夏季はスノーケリング体験も可能で、透明度抜群の海を全身で楽しむことができ、海の自然を満喫できます。

海の自然体験館では、貝殻クラフトや塩づくりなどの自然体験プログラムを提供しています。